MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBb

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015688	ATT	2	6	966	971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738948
2	NC_015688	TAA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
3	NC_015688	ATTGT	2	10	1146	1155	20 %	60 %	20 %	0 %	337738949
4	NC_015688	GTT	2	6	1167	1172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738949
5	NC_015688	ATC	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738949
6	NC_015688	CAA	2	6	1244	1249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738949
7	NC_015688	TA	3	6	1280	1285	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
8	NC_015688	AT	3	6	1323	1328	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
9	NC_015688	ATG	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738949
10	NC_015688	TCT	2	6	1402	1407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
11	NC_015688	TA	3	6	1476	1481	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
12	NC_015688	TCAAAT	2	12	1522	1533	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	337738949
13	NC_015688	ATTT	2	8	1547	1554	25 %	75 %	0 %	0 %	337738949
14	NC_015688	ATTA	2	8	1572	1579	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
15	NC_015688	CATA	2	8	1598	1605	50 %	25 %	0 %	25 %	337738949
16	NC_015688	TAA	2	6	1626	1631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
17	NC_015688	TCT	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
18	NC_015688	ATCT	2	8	1650	1657	25 %	50 %	0 %	25 %	337738949
19	NC_015688	TA	3	6	1659	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
20	NC_015688	T	6	6	1671	1676	0 %	100 %	0 %	0 %	337738949
21	NC_015688	AT	3	6	1701	1706	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
22	NC_015688	AT	3	6	1736	1741	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
23	NC_015688	ATT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738949
24	NC_015688	T	6	6	1902	1907	0 %	100 %	0 %	0 %	337738949
25	NC_015688	TAA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
26	NC_015688	TTC	2	6	2010	2015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
27	NC_015688	GTTG	2	8	2020	2027	0 %	50 %	50 %	0 %	337738949
28	NC_015688	AGTA	2	8	2043	2050	50 %	25 %	25 %	0 %	337738949
29	NC_015688	TCT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
30	NC_015688	TTC	2	6	2061	2066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
31	NC_015688	ATA	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
32	NC_015688	T	6	6	2795	2800	0 %	100 %	0 %	0 %	337738950
33	NC_015688	AAG	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738950
34	NC_015688	ACC	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738950
35	NC_015688	CCA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738950
36	NC_015688	CAT	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738950
37	NC_015688	T	6	6	2942	2947	0 %	100 %	0 %	0 %	337738950
38	NC_015688	TTTTA	2	10	2958	2967	20 %	80 %	0 %	0 %	337738950
39	NC_015688	AAG	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738950
40	NC_015688	GAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337738950
41	NC_015688	ATA	2	6	3138	3143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738950
42	NC_015688	ATT	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738950
43	NC_015688	T	6	6	3214	3219	0 %	100 %	0 %	0 %	337738950
44	NC_015688	TGC	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738950
45	NC_015688	ATT	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738950
46	NC_015688	T	6	6	3328	3333	0 %	100 %	0 %	0 %	337738950
47	NC_015688	AT	3	6	3334	3339	50 %	50 %	0 %	0 %	337738950
48	NC_015688	ATT	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
49	NC_015688	A	7	7	3931	3937	100 %	0 %	0 %	0 %	337738951
50	NC_015688	TTTTA	2	10	3938	3947	20 %	80 %	0 %	0 %	337738951
51	NC_015688	TATATG	2	12	3961	3972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337738951
52	NC_015688	GAT	2	6	4070	4075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
53	NC_015688	TAA	3	9	4111	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
54	NC_015688	GTATA	2	10	4129	4138	40 %	40 %	20 %	0 %	337738951
55	NC_015688	ATA	2	6	4149	4154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
56	NC_015688	GAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
57	NC_015688	ACA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738951
58	NC_015688	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	337738951
59	NC_015688	ATT	3	9	4290	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
60	NC_015688	ACAAA	2	10	4327	4336	80 %	0 %	0 %	20 %	337738951
61	NC_015688	ACT	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738951
62	NC_015688	ATT	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
63	NC_015688	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
64	NC_015688	AAT	2	6	4430	4435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
65	NC_015688	TAA	2	6	4453	4458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
66	NC_015688	TAC	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738951
67	NC_015688	A	6	6	4488	4493	100 %	0 %	0 %	0 %	337738951
68	NC_015688	TGA	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
69	NC_015688	TGA	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
70	NC_015688	ACA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738951
71	NC_015688	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
72	NC_015688	A	6	6	4694	4699	100 %	0 %	0 %	0 %	337738951
73	NC_015688	AAT	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
74	NC_015688	AT	3	6	4713	4718	50 %	50 %	0 %	0 %	337738951
75	NC_015688	AAAT	2	8	4776	4783	75 %	25 %	0 %	0 %	337738951
76	NC_015688	AAT	3	9	4781	4789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
77	NC_015688	TGT	3	9	4795	4803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738951
78	NC_015688	ATG	3	9	4917	4925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
79	NC_015688	GAT	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
80	NC_015688	TA	3	6	4988	4993	50 %	50 %	0 %	0 %	337738951
81	NC_015688	ATAA	2	8	5038	5045	75 %	25 %	0 %	0 %	337738952
82	NC_015688	A	6	6	5044	5049	100 %	0 %	0 %	0 %	337738952
83	NC_015688	ATT	2	6	5116	5121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738952
84	NC_015688	GCT	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738952
85	NC_015688	A	7	7	5145	5151	100 %	0 %	0 %	0 %	337738952
86	NC_015688	AT	5	10	5166	5175	50 %	50 %	0 %	0 %	337738952
87	NC_015688	TAA	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
88	NC_015688	TCT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738952
89	NC_015688	A	6	6	5220	5225	100 %	0 %	0 %	0 %	337738952
90	NC_015688	A	7	7	5238	5244	100 %	0 %	0 %	0 %	337738952
91	NC_015688	TA	3	6	5267	5272	50 %	50 %	0 %	0 %	337738952
92	NC_015688	ATA	2	6	5282	5287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
93	NC_015688	A	6	6	5287	5292	100 %	0 %	0 %	0 %	337738952
94	NC_015688	A	6	6	5326	5331	100 %	0 %	0 %	0 %	337738952
95	NC_015688	A	6	6	5346	5351	100 %	0 %	0 %	0 %	337738952
96	NC_015688	A	6	6	5379	5384	100 %	0 %	0 %	0 %	337738952
97	NC_015688	CTC	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337738952
98	NC_015688	ATA	3	9	5441	5449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
99	NC_015688	CAC	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738952
100	NC_015688	TAT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738952
101	NC_015688	GTA	2	6	5671	5676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738952
102	NC_015688	TAT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738952
103	NC_015688	TA	4	8	5691	5698	50 %	50 %	0 %	0 %	337738952
104	NC_015688	TAG	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738952
105	NC_015688	AAT	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
106	NC_015688	TAAA	2	8	5753	5760	75 %	25 %	0 %	0 %	337738952
107	NC_015688	T	6	6	5770	5775	0 %	100 %	0 %	0 %	337738952
108	NC_015688	TAA	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
109	NC_015688	CTCA	2	8	5903	5910	25 %	25 %	0 %	50 %	337738952
110	NC_015688	TAG	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738952
111	NC_015688	CAAAT	2	10	5973	5982	60 %	20 %	0 %	20 %	337738952
112	NC_015688	AAC	2	6	6037	6042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738952
113	NC_015688	GAA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738953
114	NC_015688	AAT	2	6	6666	6671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738953
115	NC_015688	ATT	2	6	7285	7290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738954
116	NC_015688	T	6	6	7289	7294	0 %	100 %	0 %	0 %	337738954
117	NC_015688	GTT	2	6	7410	7415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738954
118	NC_015688	TCTATT	2	12	7436	7447	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	337738954
119	NC_015688	ACA	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738954
120	NC_015688	TA	4	8	7532	7539	50 %	50 %	0 %	0 %	337738954
121	NC_015688	ATC	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738954
122	NC_015688	AC	3	6	7567	7572	50 %	0 %	0 %	50 %	337738954
123	NC_015688	AT	4	8	7678	7685	50 %	50 %	0 %	0 %	337738954
124	NC_015688	T	6	6	7690	7695	0 %	100 %	0 %	0 %	337738954
125	NC_015688	ATCT	2	8	7699	7706	25 %	50 %	0 %	25 %	337738954
126	NC_015688	TTA	2	6	7812	7817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738954
127	NC_015688	ATAG	2	8	8121	8128	50 %	25 %	25 %	0 %	337738955
128	NC_015688	TGGTAT	2	12	8185	8196	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	337738955
129	NC_015688	CTG	2	6	8208	8213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738955
130	NC_015688	TTAT	2	8	8222	8229	25 %	75 %	0 %	0 %	337738955
131	NC_015688	ATT	2	6	8233	8238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
132	NC_015688	AGT	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738955
133	NC_015688	ATT	2	6	8248	8253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
134	NC_015688	TTA	2	6	8307	8312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
135	NC_015688	TTA	2	6	8315	8320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
136	NC_015688	ATT	2	6	8326	8331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
137	NC_015688	T	6	6	8352	8357	0 %	100 %	0 %	0 %	337738955
138	NC_015688	TA	3	6	8366	8371	50 %	50 %	0 %	0 %	337738955
139	NC_015688	TAA	2	6	8375	8380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
140	NC_015688	T	6	6	8398	8403	0 %	100 %	0 %	0 %	337738955
141	NC_015688	AAT	2	6	8421	8426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
142	NC_015688	AAT	2	6	8445	8450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
143	NC_015688	ATA	2	6	8488	8493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
144	NC_015688	AT	3	6	8547	8552	50 %	50 %	0 %	0 %	337738955
145	NC_015688	CAAT	2	8	8553	8560	50 %	25 %	0 %	25 %	337738955
146	NC_015688	ATTA	2	8	8575	8582	50 %	50 %	0 %	0 %	337738955
147	NC_015688	AT	3	6	8599	8604	50 %	50 %	0 %	0 %	337738955
148	NC_015688	GTA	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738955
149	NC_015688	TACT	2	8	8648	8655	25 %	50 %	0 %	25 %	337738955
150	NC_015688	ACT	2	6	8683	8688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738955
151	NC_015688	AT	3	6	8705	8710	50 %	50 %	0 %	0 %	337738955
152	NC_015688	TTA	2	6	8727	8732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
153	NC_015688	AAT	2	6	8861	8866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
154	NC_015688	AATT	2	8	8874	8881	50 %	50 %	0 %	0 %	337738955
155	NC_015688	A	7	7	8899	8905	100 %	0 %	0 %	0 %	337738955
156	NC_015688	AAT	2	6	8940	8945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
157	NC_015688	T	7	7	8962	8968	0 %	100 %	0 %	0 %	337738955
158	NC_015688	ATC	2	6	9001	9006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738955
159	NC_015688	ATTGT	2	10	9027	9036	20 %	60 %	20 %	0 %	337738955
160	NC_015688	CCAA	2	8	9791	9798	50 %	0 %	0 %	50 %	337738956
161	NC_015688	TAA	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738956
162	NC_015688	CTT	2	6	9877	9882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
163	NC_015688	AGT	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738956
164	NC_015688	CTT	2	6	9948	9953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
165	NC_015688	CTT	2	6	9978	9983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
166	NC_015688	TAT	3	9	10003	10011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738956
167	NC_015688	CTT	2	6	10194	10199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
168	NC_015688	TAA	2	6	10264	10269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738956
169	NC_015688	TTA	2	6	10271	10276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738956
170	NC_015688	AT	3	6	10291	10296	50 %	50 %	0 %	0 %	337738956
171	NC_015688	TA	3	6	10308	10313	50 %	50 %	0 %	0 %	337738956
172	NC_015688	TAT	2	6	10321	10326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738956
173	NC_015688	CTG	2	6	10329	10334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738956
174	NC_015688	AT	3	6	10408	10413	50 %	50 %	0 %	0 %	337738956

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.